Modelowanie molekularne dla projektowania leków

obowiązkowe

Oddziaływanie leków z celami molekularnymi 1200-2BLOK7-BIOW6
Receptory GPCR - struktury, działanie, leki 1200-RGPRC-OG

Zapoznanie się z rodzajami celów molekularnych i rodzajami leków, oraz poznanie w jaki sposób leki mogą z nimi oddziaływać aby je blokować lub aktywować.

w sali
zdalnie

Zapoznanie z metodami modelowania i wizualizacji molekuł chemicznych i biologicznych pod kątem wykorzystania tych metod dla projektowania leków. Będą także omówione serwisy internetowe oraz bazy danych odnoszące się do leków i ich celów molekularnych.

Metody modelowania molekularnego i wizualizacji stanowią obecnie jedną z podstawowych części składających się na metodykę projektowania leków. Odnosi się to zarówno dla projektowania leków w oparciu o strukturę celu molekularnego (structure-based drug design) jak i bez tej struktury w oparciu tylko o aktywne i nieaktywne związki chemiczne (ligand-based drug design). W ramach wykładu zostaną omówione podstawy modelowania molekularnego (model CPK), definicja pola siłowego i jego zastosowanie w mechanice i dynamice molekularnej. Zostaną także przedstawione programy do wizualizacji molekuł chemicznych i biologicznych, budowania i modyfikacji związków chemicznych i białek, oraz elementy programowania. Ważnym elementem projektowania leków jest także umiejętność korzystania z internetowych baz danych związków chemicznych i celów molekularnych (białka, DNA, RNA) – zostaną omówione rodzaje informacji jakie się tam znajdują i jak z nich korzystać.

---

Po zakończeniu wykładu student powinien znać najważniejsze metody modelowania i wizualizacji struktur jak i dynamiki białek, oraz umieć wyszukiwać potrzebne informacje z internetowych baz danych struktur związków chemicznych i biologicznych celów molekularnych.

Wymagania związane z uczestnictwem w zajęciach - brak.

Dopuszczalna liczba nieobecności usprawiedliwionych - 50 %.

Egzamin testowy z 50% pytań zamkniętych i 50% pytań otwartych -

tak samo dla zaliczenia poprawkowego.

Wymagane minimum 50% poprawnych odpowiedzi do zaliczenia.

Nie dotyczy